核心定位:根据客户需求设计并构建重组质粒,包括目的基因克隆、载体改造、元件组装等,是基因功能研究、蛋白表达、基因编辑等实验的基础技术服务,可提供从序列设计到质粒鉴定的全流程解决方案。
质粒构建是将目的基因片段与载体(如克隆载体 pUC19、表达载体 pcDNA3.1、慢病毒载体 pLVX 等)通过酶切、连接等分子生物学操作,组装成可在宿主细胞(如大肠杆菌、哺乳动物细胞)中复制或表达的重组质粒的过程,核心是实现目的基因的体外扩增与功能研究。
• 酶切反应:使用限制性内切酶(如 EcoRⅠ、BamHⅠ)切割目的基因片段与载体,产生互补的黏性末端或平末端,为后续连接做准备;
• 连接反应:通过 DNA 连接酶(如 T4 DNA 连接酶)将酶切后的目的基因片段与载体连接,形成重组质粒;
• 转化与筛选:将重组质粒导入感受态细胞(如大肠杆菌 DH5α),通过抗性筛选(如氨苄青霉素抗性、卡那霉素抗性)及菌落 PCR、测序验证,获得阳性克隆。
基因功能研究:构建过表达质粒、RNA 干扰质粒,探究目的基因对细胞表型的影响
蛋白表达制备:构建原核表达质粒(如 pET-28a)、真核表达质粒(如 pcDNA3.1),用于重组蛋白纯化
基因编辑工具构建:构建 CRISPR/Cas9 质粒、TALEN 质粒,实现特定基因的敲除或敲入
报告基因实验:构建荧光素酶报告质粒、GFP 融合质粒,用于启动子活性分析或蛋白定位研究
1. 需求确认与序列设计
◦ 明确客户需求:包括载体类型(克隆 / 表达 / 病毒载体)、目的基因来源(cDNA / 基因组 DNA / 合成序列)、元件插入(如启动子、标签蛋白 HA/Flag/GFP、终止子);
◦ 序列分析:通过软件(如 Vector NTI、SnapGene)分析目的基因与载体的酶切位点,避免目的基因内部含有所选酶切位点,确定最佳酶切方案(单酶切 / 双酶切)。
1. 材料准备
◦ 目的基因模板:客户提供或根据序列合成 cDNA;
◦ 载体:根据需求选择商业化载体或客户提供载体;
◦ 试剂:限制性内切酶、T4 DNA 连接酶、DNA 聚合酶、琼脂糖、DNA Marker、感受态细胞、抗性培养基等。
1. 目的基因扩增(PCR 法)
◦ 根据目的基因序列设计特异性引物(5' 端引入与载体匹配的酶切位点及保护碱基);
◦ 以 cDNA 或基因组 DNA 为模板,通过 PCR 扩增目的基因片段,反应结束后进行琼脂糖凝胶电泳,切胶回收纯化目的基因(使用胶回收试剂盒)。
1. 载体酶切与纯化
◦ 按照酶切体系(载体 DNA 1μg、限制性内切酶 1-2μL、缓冲液 2μL、无酶水补至 20μL),37℃孵育 1-2 小时;
◦ 若为双酶切,需确认两种酶的兼容缓冲液,同步或分步进行酶切;
◦ 酶切产物经琼脂糖凝胶电泳后,切胶回收线性化载体(去除环状载体,避免自连)。
1. 目的基因与载体连接
◦ 按照连接体系(目的基因片段 30-50ng、线性化载体 10ng、T4 DNA 连接酶 1μL、连接缓冲液 2μL、无酶水补至 20μL),16℃连接过夜(或 25℃连接 30 分钟,根据连接酶类型调整)。
1. 转化感受态细胞
◦ 取 10μL 连接产物加入 100μL 感受态细胞(如 DH5α),冰浴 30 分钟;
◦ 42℃热激 90 秒,迅速冰浴 2 分钟;
◦ 加入 800μL 无抗 LB 培养基,37℃、200rpm 振荡培养 1 小时,使细胞恢复活性并表达抗性基因。
1. 抗性筛选与菌落 PCR 鉴定
◦ 取 100μL 培养物均匀涂布于含对应抗性的 LB 琼脂平板(如氨苄青霉素抗性平板),37℃倒置培养 12-16 小时;
◦ 挑选 3-5 个单菌落,分别接种至含抗性的 LB 液体培养基,37℃振荡培养 8 小时;
◦ 以菌液为模板,用目的基因特异性引物进行菌落 PCR,电泳检测阳性菌液(出现预期大小条带即为阳性)。
1. 测序验证与质粒提取
◦ 选取 2-3 个阳性菌液送测序,验证目的基因序列正确性(无碱基突变、插入或缺失)及插入方向正确性;
◦ 对测序正确的菌液,使用质粒提取试剂盒(小提 / 中提 / 大提,根据客户需求)提取重组质粒,测定质粒浓度与纯度(Nanodrop 检测 OD260/OD280,比值 1.8-2.0 为合格)。
• 质粒转染验证:将重组质粒转染至哺乳动物细胞(如 HEK293T),通过 Western blot(检测标签蛋白)或荧光显微镜(检测 GFP 等荧光标签)验证目的基因表达;
• 病毒包装:若为病毒载体(慢病毒、腺病毒),进一步进行病毒包装与滴度测定。
实验步骤 | 结果呈现形式 | 判定标准 |
目的基因 PCR 扩增 | 琼脂糖凝胶电泳图 | 出现与目的基因大小一致的单一条带,无杂带 |
载体酶切 | 琼脂糖凝胶电泳图 | 线性化载体条带单一,无环状载体残留 |
菌落 PCR 鉴定 | 琼脂糖凝胶电泳图 | 阳性菌落出现预期大小条带,阴性无条带 |
测序验证 | 测序报告(含测序峰图、序列比对结果) | 目的基因序列与参考序列 100% 匹配,插入方向正确 |
质粒提取 | Nanodrop 检测报告、琼脂糖凝胶电泳图 | 质粒浓度≥50ng/μL,OD260/OD280 1.8-2.0,电泳呈单一超螺旋条带 |
1. 重组质粒:根据客户需求提供不同量的纯化质粒(小提 10-20μg、中提 100-200μg、大提 1mg 以上),溶于无酶水或 TE 缓冲液;
2. 实验报告:包含实验流程(酶切方案、连接条件、测序结果)、关键步骤电泳图、测序报告、质粒浓度与纯度检测数据;
3. 剩余材料:剩余阳性菌液(甘油保存,-80℃可长期存放)、未用完的引物等(若有剩余)。
• 若测序结果显示目的基因序列正确、插入方向无误,且质粒浓度与纯度达标,表明质粒构建成功,可直接用于后续实验(如细胞转染、蛋白表达);
• 若出现序列突变或插入方向错误,将重新优化构建方案(如调整引物设计、更换酶切位点),免费进行二次构建,确保交付合格质粒。